تشغل الدكتورة إيلينا ماناينكوفا منصب نائبة الأمين العام منذ عام 2016. وقبل تعيينها في هذا المنصب، شغلت منصب الأمينة العامة المساعدة في المنظمة منذ عام 2010، وعملت قبل ذلك مديرة لمكتب الأمين العام وإدارة العلاقات الخارجية منذ عام 2006.
وقد انضمت الدكتورة ماناينكوفا إلى المنظمة في كانون الثاني/ يناير 2003 عندما شغلت منصب مديرة إدارة بحوث الغلاف الجوي والبيئة. وهي خبيرة جغرافية متخصصة في الهيدرولوجيا والأرصاد الجوية. وتخرجت في جامعة موسكو الحكومية في عام 1986. وحصلت على شهادة الدكتوراه في الفيزياء والرياضيات من مركز الأرصاد الجوية الهيدرولوجية في روسيا (1993) وتخصصت في الأرصاد الجوية وعلم المناخ والأرصاد الجوية الساتلية والاستشعار عن بُعد عن طريق السواتل.
وقبل الانضمام إلى المنظمة، كرّست الدكتورة ماناينكوفا مسيرتها الوظيفية لدائرة الأرصاد الجوية الهيدرولوجية ومراقبة البيئة بالاتحاد الروسي، واستهلت هذه المسيرة بالعمل مسؤولة علمية في مركز الأرصاد الجوية الهيدرولوجية بروسيا - مركز الأرصاد الجوية العالمي التابع للمنظمة، ثم عملت في مركز البحوث العلمية للأرصاد الجوية الهيدرولوجية الفضائية "Planeta"، وتدرجت في المناصب وزادت مسؤولياتها، حتى وصلت إلى منصب الأمين العلمي ومدير إدارة العلوم والتعاون الدولي.
وقد وُلدت الدكتورة ماناينكوفا في عام 1964 في موسكو، روسيا. وهي متزوجة وأم لاثنين من الأولاد.
وبدأت الدكتورة ماناينكوفا مزاولة مهامها كنائبة للأمين العام في 1 أيلول/ سبتمبر 2016.